1、前者不全是免費，但很便宜，而后者是商用數據庫系統，所以比前者貴；
2、前者適合小、中型網站，對于不是特別大流量的網站，效率好，而后者一般是企業級的商務網站使用的。
MySQL
MySQL是一個關系型數據庫管理系統，由瑞典MySQL AB 公司開發，屬于?oracle?旗下產品。MySQL 是最流行的關系型數據庫管理系統之一，在 WEB 應用方面，MySQL是最好的?RDBMS?(Relational database Management System，關系數據庫管理系統) 應用軟件之一。
MySQL是一種關系型數據庫管理系統，關系數據庫將數據保存在不同的表中，而不是將所有數據放在一個大倉庫內，這樣就增加了速度并提高了靈活性。
MySQL所使用的 SQL 語言是用于訪問數據庫的最常用標準化語言。MySQL 軟件采用了雙授權政策，分為社區版和商業版，由于其體積小、速度快、總體擁有成本低，尤其是開放源碼這一特點，一般中小型網站的開發都選擇 MySQL 作為網站數據庫。
SQL Server
SQL Server 是一個關系數據庫管理系統。它最初是由microsoft、Sybase 和Ashton-Tate三家公司共同開發的，于1988 年推出了第一個OS/2版本。在windows NT 推出后，Microsoft與Sybase 在SQL Server 的開發上就分道揚鑣了，Microsoft 將SQL Server移植到Windows NT系統上，專注于開發推廣SQL Server 的Windows NT 版本。Sybase 則較專注于SQL Server在UNⅨ操作系統上的應用。
SQL Server 2000?是Microsoft 公司推出的SQL Server數據庫管理系統，該版本繼承了SQL Server 7.0 版本的優點，同時又比它增加了許多更先進的功能。具有使用方便可伸縮性好與相關軟件集成
程度高等優點，可跨越從運行Microsoft Windows 98 的膝上型電腦到運行Microsoft Windows 2000 的大型多處理器的服務器等多種平臺使用。
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